Wielange dauert es bei abgeschaltetem WLAN? Vielleicht wartet RetroPie beim Booten auf die schlechte WLAN-Verbindung. (Wilde Vermutung, denn den von Dir beschriebenen Effekt kenne ich bislang nicht.) edit: Hast Du irgendwelche externen Netzwerkverzeichnisse in RetroPie eingehängt? Wozu braucht er im Normalbetrieb das Netzwerk?
Wie gut das WLAN-Modul des Raspi ist, weiß ich auch nicht. Aber er ist halt primär auf Kompaktheit hin optimiert und hat keine längere Antenne wie sie meines Wissens viele Laptops irgendwo in Ihrem Gehäuse verlegt haben.
Du könntest ggf. einen USB-WLAN-Stick mit Antenne und/oder einen WLAN-Repeater kaufen, wenn es Dir wichtig genug ist.